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vendredi 1 février 2019

#Cell #cellule #positionnementgénique #décodage Décodage Optimal des Identités Cellulaires dans un Réseau Génétique

Gap genes = Gènes de Segmentation Gap
Encode positional information = Codage de l'Information de Positionnement
Decode Protein Concentrations {g} into probalistic maps of position x = Décodage des Concentrations en Protéine en Position sur la Carte Génétique exprimée en termes Probabilistes
P (xΙ{g}) = P (xΙ{g})
Pair-rule genes = Gènes de Segmentation "pair - rule"
Read positional information = Lecture de l'information sur le positionnement
Dans les organismes en développement, on pense que les identités cellulaires spatialement bien définies sont déterminées par le niveau d’expression de multiples gènes. Les tests quantitatifs d’évaluation de ce point de vue requièrent cependant un cadre théorique capable d’exposer les règles et précisions de la spéciation cellulaires se développant avec le temps. Nous avons utilisé le réseau de gènes de segmentation gap chez des embryons de mouche à un stade précoce comme exemple, montrant comment les niveaux d’expression des quatre gènes de segmentation peuvent être décodés simultanément avec une précision exprimée en pourcentage à 1% près. Le décodeur prédit correctement, sans paramètres libres, la dynamique de schémas d’expression à différents temps au cours du développement et dans divers contextes mutants. Des identités cellulaires précises sont donc disponibles à des stades précoces de développement, contrastant avec l’opinion jusqu’à présent dominante selon laquelle l’information sur les données de positionnement sont s’affinent très progressivement en fonction de chacun des niveaux successifs de structuration du réseau. Nos résultats suggèrent que les amplificateurs du développement arborent une stratégie optimale mathématique de décodage. Mariela D. Petlkova, et al, dans Cell, publication en ligne en avant-première, 31 janvier 2019

Source iconographique, légendaire et rédactionnelle : Science Direct / Traduction et adaptation : NZ

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