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mardi 19 juillet 2016

#Cell #codegénétique #traduction #terminaison #codonstop Codes Génétiques sans Codon Stop Dédié : Terminaison de Traduction Contexte-Dépendante

Coding sequence = Séquence codante
Translation = Traduction
3' untranslated region = Région 3' non traduite
poly(A) tail = queue de poly(A)
Chez certains ciliés, les trois codons stop peuvent soit terminer la traduction, soit coder pour un acide aminé ; (…) indiquant qu’une  terminaison de la traduction relayée par les ribosomes peut être contexte dépendante.  
La vision la plus répandue du Code Génétique est qu’il est largement gelé et non ambigu*. La flexibilité du code génétique a été démontrée chez les ciliés, qui réaffectent les codons stop standard en codons sens codant pour des acides aminés, résultant ce faisant en sept variants génétiques différents chez les ciliés, dont trois non décrits précédemment. Étonnamment, nous constatons une traduction efficace de tous les 64 codons standards en acides aminés, chez deux de ces espèces ainsi qu’une reconnaissance d’un ou trois codons stop.  Comment donc la machinerie de traduction interprète - t - elle le codon « stop » ? Nous apportons ici des évidences - à partir du profil ribosomique et du profil de codons « stop » avant que ne se termine la séquence codante, que l’extrémité 3’ de l’ARNm contribue à distinguer les codons stop des codons sens d’une manière environnement dépendante. Nous proposons par la suite qu’un tel phénomène de terminaison/translecture proche de l’extrémité des transcrits permet l’évolution du code génétique. Estienne Carl Swart, et al, dans Cell, publication en ligne en avant-première, 14 juillet 2016

Source iconographique, légendaire et rédactionnelle: Science Direct / Traduction et adaptation : NZ

Note Complémentaire à ce post: 

*« Hypothèse d'un gel du code génétique »Cette hypothèse propose que les organismes dérivent tous d'un ancêtre unique et que le code ait été gelé durant l'évolution parce que tout changement du code serait devenu létal pour les organismes (Francis Crick, 1966)

vendredi 5 juin 2015

#Cell #ARNm #ARNt #ribosome #protéine #codon #anticodon #traduction #protéome L’Optimisation des Niveaux de Traduction de Codon par Modifications de l’ARNt Maintient l’Intégrité du Protéome

Un niveau optimal de traduction de codon -assuré par des modifications des nucléosides de l'anticodon de l'ARNt- est indispensable au maintien de l'intégrité du protéome.
Le repliement des protéines commence dès leur naissance, émergeant des ribosomes en activité de traduction. La cinétique d’évolution du ribosome le long de l’ARNm peut agir sur le repliement d’une chaîne naissante, toutefois, l’impact de l’amplitude des niveaux de traduction pour chaque codon pris individuellement reste inconnue. Ici, nous montrons qu’un décryptage plus lent de certains codons déclenche une importante agrégation de protéines in vivo. Grâce à l’établissement d’un profil ribosomique, nous montrons que la perte des modifications d’un anticodon wobble uridine (U34) dans un échantillon d’ARNts mène à une interruption momentanée (pause) de l’activité du ribosome au niveau de leurs codons correspondants chez  S. cerevisiae et C. elegans. Les cellules exemptes de modification U34 montrent des caractéristiques d’expression génique en situation de stress protéotoxique, accumulent des agrégats de protéines endogènes, et n’assurent plus le dégagement des agrégats de protéines induites par le stress. La surexpression d’ARNts sous-modifiés* atténue l’impact de la pause de l’activité ribosomale, restaurant ce faisant l’homéostasie des protéines. Nos résultats démontrent qu’un U34 modifié représente un outil de décodage conservé sur le plan évolutif et révèlent un rôle imprévu des modifications de l’ARNt dans le maintien de l’intégrité du protéome. Danny D. Nedialkova, Sebastian A. Leidel, dans Cell, publication en ligne en avant – première, 4 juin 2015

*subissant moins de modifications qu'en situation dite "normale" (Wikipedia)

Source iconographique, légendaire et rédactionnelle : Science Direct / Traduction et adaptation : NZ