#Cell #cancerdelaprostate #génomique Altérations Structurelles Entraînant un Cancer de la Prostate Résistant à la Castration Révélé par Séquençage Génomique

Castration-Resistant Prostate Cancer = Cancer de la Prostate Résistant à la Castration
Linked-Read Whole Genome Sequencing = Séquençage du Génome Entier à Lecture Synchronisée
Metastatic tumor biopsy = Biopsie de tumeur métastasée
Cell-free DNA = ADN acellulaire
structural alterations = altérations structurelles
linked - read = lecture synchronisée
Enhancer = Séquence Activatrice
AR = Récepteur aux Androgènes
AR Enhancer Duplications = Duplications de la Séquence Activatrice du Recepteur aux Androgènes
Tandem Duplicator Phenotype = Phénotype de Duplication en Tandem
chrX = chromosome X
Copy Number = Nombre de Copies
PSA progression = Niveau (progression) de l'Antigène Spécifique de la Prostate
AR & Enhancer Gains with Progression = Enrichissement en Récepteur aux Androgènes et en Séquence Activatrice en fonction de la Progression

Presque tous les décès par cancer de la prostate révèlent de fait un cancer de la prostate résistant à la castration métastasé (mCRPC) ; on ne comptabilise toutefois que peu d’études de séquençage sur génome entier (WGS) réalisées à ce stade de la maladie. Nous avons effectué une étude WGS sur 23 échantillons de biopsies de mCRPC et analysé les données de séquençage d’ADN acellulaire provenant de 86 patients atteints de mCRPC. Outre les fréquents réarrangements affectant les gènes connus du cancer de la prostate, nous avons observé des réarrangements du locus AR (Récepteurs aux Androgènes - Androgen Receptor dans le texte -) dans la plupart des cas. 

Ces réarrangements incluent, de manière inattendue, des duplications en tandem hautement récurrentes impliquant une séquence activatrice de l’AR en amont dans 70% à 87% des cas en comparaison de la proportion <2% observée dans les cancers de la prostate primaires. Certains cas ont présenté des duplications activatrices de AR ou MYC dans le contexte d’un phénotype de duplication en tandem au niveau du génome entier associé à une inactivation de CDK12. Nos résultats soulignent la complexité de la structure génomique du mCRPC, désignent des altérations indicatrices dans le traitement du cancer de la prostate, et laissent entendre que d’autres événements récurrents restent à découvrir au niveau du génome non codant du mCRPC. Srinivas R. Viswanathan, et al, dans Cell, publication en ligne en avant-première, 18 juin 2018

Source iconographique, légendaire et rédactionnelle : Science Direct / Traduction et adaptation : NZ

Génération de boucles de chromatine dirigée par les récepteurs aux androgènes

Formation de boucles de chromatine stimulée par les hormones. La liaison du récepteur aux androgènes (RA) aux zones enhancer et promoter du gène spécifique aux antigènes de la prostate sert de relai au repliage de l'ADN, à l'assemblage des cofacteurs (dessins ovales non - légendés), et à la traque du site de démarrage de la transcription du gène (TATA) par l'ARN polymerase (Pol II). Source: archives.focus.hms.harvard.edu/2005/Sep30_200...

Le récepteur aux androgènes (RA) est important pour le développement et la progression du cancer de la prostate. La cartographie au niveau du génome entier des RA dans le cancer de la prostate montre que la majorité des sites de liaison aux RA sont localisés dans les régions non promotrices. Ces régions distales des sites de liaison des RA soumettent à régulation les gènes cibles des RA (par exemple UBE2C), impliqués dans le développement du cancer de la prostate par l'intermédiaire du développement en boucles de la chromatine. En plus de la régulation génique à longue distance, le phénomène des boucles de chromatine induit une proximité spatiale de 2 gènes, qui seraient autrement physiquement éloignés l'un de l'autre sur le plan de la séquence génomique; et d'induire la formation de cassures de l'ADN double - brin, résultant en des fusions erratiques de gènes (par exemple TMPRSS2-ERG), qui contribuent aussi au développement des tumeurs de la prostate.

L'élucidation des mécanismes qui président à la formation des boucles de chromatine par les RA améliorera considérablement notre compréhension de la carcinogénèse au niveau de la prostate, et pourrait aboutir à l'identification de nouvelles cibles thérapeutiques. Dayong Wu et al, in Trends in Endocrinology and Metabolism - 749, online 31 August 2011, in press.

Source: http://www.sciencedirect.com/ / Traduction et adaptation: NZ