#Cell #développement #foetus #intestin Analyse spatiotemporelle du développement de l’intestin chez l’homme avec une résolution au niveau de la cellule

Développement au cours du temps - Analyse au niveau de la cellule unique - Transcriptomique Spatiale
STAR-FINDer: Analyse Spatio-Temporelle du Développement de l'Intestin chez le Foetus Humain

 

Le développement de l’intestin humain reste largement méconnu. Ici, nous établissons le lien entre le séquençage de l’ARN et la transcriptomique spatiale pour caractériser la morphogénèse intestinale avec le temps. Nous identifions 101 états cellulaires incluant des populations de cellules mésenchymateuses progénitrices ainsi que les programmes liés aux étapes morphogénétiques clés. Nous décrivons les principes de la formation de l’axe cryptes – villosités ; de la morphogénèse neurale, vasculaire, et mésenchymateuse, et de la population immunitaire de l’intestin en développement. Nous identifions les hiérarchies de différenciation des sous-types de fibroblastes en de myofibroblastes en développement et décrivons leurs diverses fonctions, en tant que cellules de niche vasculaires notamment. Nous précisons les origines des plaques de Peyer et celle du tissu lymphoïde associé à l’intestin (GALT) et décrivons les localisations spécifiques des différents profils immunitaires existants. Nous faisons usage de nos ressources pour présenter une analyse impartiale des gradients morphogénétique constituant la force motrice des oscillations séquentielles de différentiation cellulaire et définissons les cellules et les localisations liées aux troubles rares du développement intestinal. Nous réalisons des ressources en ligne accessibles au public, des analyses spatio-temporelles du développement de l’intestin chez le fœtus (STAR-FINDer), ouvrant ainsi la voie vers de futures recherches. David Fawkner-Corbett, et al, dans Cell, publication en ligne en avant-première, 5 janvier 2021

Source iconographique, légendaire et rédactionnelle : Science Direct / Traduction et adaptation : NZ

#cell #immunothérapie #nivolumab Tumeur et Évolution du Microenvironnement au cours de l’Immunothérapie sous Nivolumab

Immune checkpoint blockade therapy = Thérapie par blocage du point de contrôle immunitaire
High tumor mutation load/burden correlates with increased neoantigens = Une charge mutationnelle tumorale élevée est en corrélation avec une augmentation des néoantigènes
Tumor cells expressing certain neoantigens are lost = Les cellules tumorales exprimant certains néoantigènes disparaissent
Clonal T-cell populations expand in proportion to the number of neoantigens lost = Les population de clones de cellules T augmentent en proportion du nombre de néoantigènes perdus
Changes occur in the microenvironment and gene expresison programs = Les changements surviennent dans le microenvironnement et les programmes d'expression des gènes
Response to therapy = Réponse au traitement
Host immunity associataed genes = Gènes associés à l'immunité de l'hôte
Stromal and tumor associated genes = gènes associés aux cellules tumorales et aux cellules stromales

Les mécanismes par lesquels le blocage du point de contrôle immunitaire modulent l’évolution de la tumeur pendant la thérapie restent incompris. Nous avons évalué les changements génomiques des tumeurs chez 68 patients atteints de mélanome avancé - dont la maladie avait progressé sous ipilimumab ou qui n’avaient pas reçu d’ipilimumab - après initiation d’un traitement nivolumab (étude CA209-038). Les tumeurs étaient analysées par séquençage de l’exome entier, du transcriptome, et/ou du récepteur aux cellules T (TCR). Chez les patients présentant une réponse, la charge mutationnelle et le niveau d’expression des néoantigènes étaient diminués par rapport à la ligne de base, et l’analyse de l’hétérogénéité intratumorale pendant la thérapie a démontré une évolution clonale différentielle au sein des tumeurs et une sélection éventuelle contre les mutations néoantigéniques au cours du traitement. Les analyses de transcriptome avant et pendant la traitement sous nivolumab ont révélé des augmentations dans des échantillons de cellules immunitaires distincts, l’activation de réseaux transcriptionnels, et une régulation positive de gènes codant pour points de contrôle immunitaire distincts se révélant plus prononcée chez les patients présentant une réponse. Les changements temporels du répertoire des TCRs intratumorales ont révélé l’expansion de clones de cellules T dans un contexte d’un affaiblissement néoantigénique. Les données complètes de profilage de cette étude fournissent un aperçu du mode d’action du nivolumab. Nadeem Riaz, et al, dans Cell, publication en ligne en avant-première, 12 octobre 2017

Source iconographique, légendaire et rédactionnelle : Science Direct / Traduction et adaptation : NZ 

Coordination de la signalisation en biologie du développement: rôles nouveaux de la voie de signalisation Hippo



"La voie suppresseur de tumeur Hippo, découverte chez la drosophile, est une voie de signalisation essentielle à la restriction de la taille des organes. Cette voie régule l’expression de plusieurs gènes impliqués dans la croissance, la prolifération et la survie cellulaire. Les différentes protéines, nécessaires à la transmission du signal Hippo jusqu’au noyau, sont bien décrites. En revanche, le facteur de transcription, capable de se fixer sur l’ADN et d’induire l’expression des gènes cibles de la voie Hippo, n’était pas connu. En utilisant différentes approches de Biologie Moléculaire, Cellulaire et de Génétique, j’ai identifié l’un des facteurs de transcription de cette voie : la protéine Scalloped. "
Source: Youlian Goulev, www.ens-lyon.fr/Joliot-Curie/spip.php?article150

Des études génétiques et biochimiques ont défini la voie de signalisation Hippo comme médiateur central des signaux du développement et des signaux de pathogenèse. En dirigeant les événements de signalisation intracellulaire, la voie de signalisation Hippo soumet à régulation fine la prolifération cellulaire, la mort cellulaire, l'orientation et la différenciation cellulaires: l'intégration de toutes ces données détermine la taille des organes chez les animaux. Des études récentes ont montré que les processus médiés par les voies de signalisation Hippo sont interconnectés avec d'autres voies-clef de signalisation en cascade, comme celle médiée par le TGF-β ou le facteur de croissance Wnt. De plus, plusieurs rapports ont décrit un rôle dans les contacts médiés par la polarité entre les protéines dans la voie de régulation Hippo. Des détails émergents suggèrent que le dialogue entre les différents signaux constitue une force motrice dans les processus développementaux; une altération de la régulation de cette communication intercellulaire influence la progression de maladies comme le cancer. Nous passons en revue des données récentes en "mettant l'objectif ou point" sur les mécanismes d'intégration de la voie de signalisation Hippo aux autres voies de signalisation. Xarabalos Varelas and Jeffrey L. Wrana, in Trends in Cell Biology-839, online 5 December 2011, in press.

Source: http://www.sciencedirect.com/ / Traduction et adaptation: NZ