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| Multiplexed chromatin tracing = Repérage de la chromatine multiplexé High resolution chromosome traces = Empreintes de chromatine à haute résolution Multiplexed RNA imaging = Imagerie de l'ARN multiplexée Protein imaging = Imagerie des protéines Genome-scale chromatin traces = Empreintes de chromatine à l'échelle du génome transciption & nuclear organization = organisation transcriptionnelle et nucléaire Single-cell domains = Domaines chromatiniens de cellules uniques Nascent RNA = ARN naissant (transcrit) Speckles = Mouchetures d'épissage |
L’organisation tridimensionnelle (3D) de la
chromatine soumet à régulation un grand nombre de fonctions génomiques. Notre
compréhension de l’organisation 3D du génome nécessite des outils pour
visualiser directement la conformation chromatinienne dans son contexte
physiologique normal. Ici, nous faisons le compte rendu d’une technique de
visualisation de l’organisation de la chromatine à divers niveaux au niveau d’une
cellule unique à l’aide de techniques génomiques à haute capacité. Tout d’abord,
nous dévoilons l’imagerie multiplexée des centaines de loci génomiques par
hybridation séquentielle, qui permet une visualisation à haute définition des
chromosomes entiers. Ensuite, nous rendons compte d’une méthode d’hybridation in
situ par fluorescence (MERFISH) pour le suivi de la chromatine et réalisons
l’imagerie simultanée de plus de 1000 loci génomiques et transcrits naissants (d’ARN)*
de plus de 1000 gènes ainsi que leur délimitation nucléaire associée. À l’aide
de cette technologie, nous caractérisons les domaines chromatiniens, les
compartiments et les interactions trans-chromosomiques ainsi que leurs liens
fonctionnels avec la transcription au niveau des cellules uniques. Nous envisageons
une application étendue et différentes échelles de cette technologie d’imagerie
multimodale à haute capacité ; qui fournit une vision intégrée de l’organisation
de la chromatine dans son environnement structurel et fonctionnel natif. Jun-Han
Su, et al, dans Cell, publication en ligne en avant-première, 20 août 2020
*rajout de l'éditeur (NZ) du présent post de blog
Source iconographique, légendaire et
rédactionnelle : Science Direct
/ Traduction et adaptation : NZ
