#trendsinecologyandevolution #marqueursnucléaires #taxonomie #métazoaire Plaidoyer pour une Standardisation des Marqueurs Nucléaires pour la Taxonomie de l’ADN des Métazoaires

Séquence des Evénements d’Implémentation des Copies Uniques de Gènes de Métazoaires Équivalents sur le Plan Fonctionnel (orthologues) (USCOs) comme Système Universel de Marqueurs pour l’Abornement et l’Identification des Espèces. (…).

La simplicité du séquençage du code-barre ADN a propulsé un système d’identification des espèces universellement applicable à travers les embranchements zoologiques. Cependant, le fait de s’appuyer sur un fragment d’ADN mitochondrial unique présente un certain nombre d’inconvénients qui peuvent induire en erreur l’abornement et l’identification des espèces. L’implémentation de marqueurs nucléaires multiples atténuerait les limites du système actuel de code-barre de l’ADN si ces marqueurs sont applicables chez toutes les espèces, s’ils comprennent suffisamment d’information pour distinguer les espèces les plus proches, et si le séquençage et l’analyse des ces marqueurs peut être automatisée. Alors que les coûts de séquençage continuent de baisser, nous pensons qu’il est maintenant temps d’étendre les usages des codes à barre de l’ADN. Notre argumentation repose sur le fait que presque chaque copie unique universelle de gènes codant pour des protéines nucléaires fournit les caractéristiques souhaitées et pourrait être utilisée pour aborner et identifier de manière fiable les espèces animales. Jonas Eberle, et al, dans Trends in Ecology and Evolution, publication en ligne en avant-première, 15 janvier 2020

Source iconographique, légendaire et rédactionnelle : Science Direct / Traduction et adaptation : NZ

#Cell #gène #hétérogénéité La Dynamique Intrinsèque d’un Gène Humain Révèle la Base de l’Expression de l’Hétérogénéité

Marquage MS2 des loci endogènes
L'imagerie du site de transcription montre une hétérogénéité d'activité transcriptionnelle
Il est décrit ici un modèle d'intégré de régulation génique

La régulation transcriptionnelle chez les métazoaires survient par le truchement de contacts prolongés entre amplificateurs et promoteurs de gènes ; ainsi, la plupart des gènes sont transcrits en « rafales épisodiques » de synthèse d’ARN. 

Afin de comprendre la relation s’établissant entre ces deux phénomènes et la relation dynamique des gènes en réponse à des signaux s’opérant en amont, nous décrivons l’utilisation de l’imagerie de l’ARN sur cellules vivantes couplée avec la méthode de capture de conformation chromosomique au niveau du génome entier (Hi-C) et disséquons la régulation endogène du gène TFF1 répondant aux œstrogènes. 

Bien que TFF1 soit hautement inductible, nous observons de courtes périodes actives et des périodes inactives de durée variable allant de quelques minutes à plusieurs jours. L’hétérogénéité des périodes inactives donne lieu à ce que l’on appelle communément le « bruit » dans l’expression génique humaine et explique la distribution des protéines dans les tissus humains. 

Nous construisons ce faisant un modèle mathématique de régulation relayant la transcription, la structure chromosomique, et la capacité de la cellule à capter les changements de niveaux en oestrogènes et à prédire l’importante dynamique de cette hypervariabilité ; tout cela ne reflète toutefois pas un état biologique stable. Joseph Rodriguez, et al, dans Cell, publication en ligne en avant-première, 13 décembre 2018

Source iconographique, légendaire et rédactionnelle : Science Direct / Traduction et adaptation : NZ

#trendsincellbiology #métazoaires #chromosomes #kinetochore #codetubuline #mitose « Le Code Tubuline : Un Système de Navigation pour les Chromosomes Pendant la Mitose

Fuseau mitotique humain visualisé en microscopie à épifluoresence. Après fixation de cellules en mitose, le fuseau est marqué pour la tubuline en vert qui permet de visualiser les microtubules constituant l’architecture dynamique du fuseau et pour l'ADN en bleu sur la plaque métaphasique.

Source iconographique et légendaire: https://igdr.univ-rennes1.fr/fr/la-recherche/equipes-de-recherche/prigent/recherche-de-l%C3%A9quipe-cycle-cellulaire

Avant la ségrégation des chromosomes pendant la mitose chez les métazoaires, ils s’alignent à l’équateur de la cellule par un processus de condensation. Ce processus est en partie médié par les activités motrices coordonnées du kinétochore, impulsant des mouvements à spécifiquement dirigés et orientés par les populations de microtubules du fuseau. Du fait que les microtubules du fuseau sont tous constitués des mêmes hétérodimères tubuline α/β, une question de longue date était de savoir comment les chromosomes sont guidés vers des endroits précis de la cellule pendant la mitose. Cela implique l’existence de signaux environnementaux spécifiques au niveau des fuseaux, lus par les moteurs du kinétochore sur les chromosomes et qui, finalement, indiquent le trajet vers l’équateur de la cellule. Ici, nous discutons d’idées émergentes selon lesquelles les modifications post-translationnelles de la tubuline constituent le soi-disant « code tubuline », constituant LE système de navigation de la motilité du chromosome pendant les phases précoces de la mitose, avec le kinétochore comme force motrice. Marin Barisic et Helder Maiato, dans Trends in Cell Biology, publication en ligne en avant – première, 22 juin 2016

Source : Science Direct / Traduction et adaptation : NZ

#trendsinendocrinologyandmetabolism #perceptionsensorielle #entréessomatosensorielles Rôle émergent de la perception sensorielle dans le vieillissement et le métabolisme

Section de la peau d'une souris après immunohistochimie. En vert: les projections des neurones somatosensoriels; en rouge: les cellules de Merkel formant un collier autour d'un follicule pileux.
Source iconographique et légendaire:  http://www.inserm.fr/layout/set/print/espace-journalistes/les-nerfs-a-fleur-de-peau

La perception sensorielle comprend le goût, l’odorat de même que les entrées somatosensorielles (douleur, chaleur, et entrées mécanosensorielles), qui sont détectées par de multiples récepteurs sensoriels. Ces récepteurs sensoriels sont présents dans des neurones ciliés où ils détectent des changements en conditions environnementales et participent aux prises de décisions aussi diverses que le choix de nourriture, l’évitement de situations dommageables ; permettant ce faisant d’assurer la survie chez les métazoaires. De récentes études génétiques, cependant, indiquent que la perception sensorielle joue un rôle additionnel dans les fonctions physiologiques, notamment en exerçant un contrôle sur les processus énergétiques homéostatiques et sur la longévité, par le truchement des circuits neuronaux provenant des tissus sensoriels. Ici, nous passons en revue sur la manière dont ces résultats redéfinissent la signalisation métabolique et établissent ce faisant un rôle primordial dans les processus sensoriels neuroendocriniens dans le contrôle de la santé et de la longévité, avec pour but de mieux exploiter ces connaissances dans la gestion des pathologies liées au vieillissement. Céline E. Riera, Andrew Dillin, et al, dans Trends in Endocrinology and Metabolism, publication en ligne en avant – première, 8 avril 2016

Source : Science Direct / Traduction et adaptation : NZ

Rôle de la matrice extracellulaire dans la fonction des tissus métaboliques

Exemple de tissu métabolique: le tissu adipeux. Source: revue.medhyg.ch/print.php3?sid=33057

Toutes les cellules, chez les métazoaires, produisent et/ou intéragissent avec dees matrices extracellulaires (MECs) tissu-spécifiques. De telles MECs jouent un rôle structurel important, non seulement dans les tissus connectifs, mais aussi dans tous les tissus auxquels elles apportent support et ancrage des cellules. Cependant, en plus de leur rôle structurel, il est devenu de plus en plus clair que les micro-environnements tissu-spécifiques formés par les MECs jouent des rôles de transmetteur d'informations; pour ce qui est du phénotype propre comme sur l'orientation fonctionnelle des cellules spécialisées. D'autre part, de récentes études effectuées in vivo et in vitro suggèrent que les composants des MECs agissent également sur les fonctions métaboliques. Cette revue résume les données fournissant des vues nouvelles sur le rôle des MECs, en livrant des données sur le développement propre et le fonctionnement de cellules hautement spécialisées des tissus métaboliques comme les adipocytes ou les cellules beta des îlots du pancreas endocrine. Guorui Huang and Daniel S. Greenspan, in Trends in Endocrinology and Metabolism - 758, online 8 November 2011, in press

Source: http://www.sciencedirect.com/ / Traduction et adaptation: NZ