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jeudi 21 octobre 2021

#Cell #modèleinvitro #gènesmitochondriaux Un système in vitro pour faire taire l'expression des gènes mitochondriaux

Silencing = Réduction au silence (des gènes)
Steady-state = Etat stable
OXYPHOS = Oxydations Phosporylantes

 

Le génome mitochondrial humain code pour treize sous-unités centrales du système de phosphorylation oxydative, et des défauts dans l'expression des gènes mitochondriaux conduisent à de graves troubles neuromusculaires. Cependant, les mécanismes d'expression des gènes mitochondriaux restent mal compris en raison d'un manque d'approches expérimentales pour analyser ces processus. Ici, nous présentons un système in vitro pour faire taire la traduction dans les mitochondries purifiées. L'importation in vitro d'hybrides précurseurs-morpholino synthétisés chimiquement nous permet de cibler la traduction d'ARNm mitochondriaux individuels. En appliquant cette approche, nous concluons que le transcrit bicistronique chevauchant ATP8/ATP6 est traduit par un seul engagement ribosome/ARNm. Nous montrons que le recrutement des facteurs d'assemblage COX1 pour traduire les ribosomes dépend de la formation de la chaîne naissante. En définissant des interactomes spécifiques à l'ARNm pour COX1 et COX2, nous révélons une fonction inattendue de l'IGF2BP1 oncofoetal cytosolique, une protéine de liaison à l'ARN, dans la traduction mitochondriale. Nos données donnent un aperçu de la traduction mitochondriale et des stratégies innovantes pour étudier l'expression des gènes mitochondriaux. Luis Daniel Cruz-Zaragoza, et al, dans Cell, publication en ligne en avant-première, 20 octobre 2021

Source iconographique, légendaire et rédactionnelle : Science Direct / Préparation post : NZ

mercredi 27 mai 2020

#trendsincellbiology #ARNm #hétérogénéité Hétérogénéité de la traduction des ARN messagers

Aperçu des origines potentielles de l’hétérogénéité translationnelle intragénique. Les deux molécules d’ARNm présentées ici diffèrent : (i) en termes de composition du ribosome opérant leur traduction ; (ii) en termes de structure ; (iii) en termes de séquence ; (iv) en termes de modifications nucléotidiques ; et (v) en termes de protéines de liaison à l’ARN (RBPs) auxquelles elles sont liées. Prises dans leur ensemble, ces différentes caractéristiques sont la force motrice de l’hétérogénéité traductionnelle.  

Au cours de la traduction de l’ARN messager (ARNm), l’information génétique stockée sous la forme d’ARNm est traduite en une séquence de protéine. Il est impératif que cette information génétique soit traduite avec une précision extrêmement élevée. Étonnamment, cependant, de récentes évidences expérimentales ont démontré que cette traduction peut être hautement hétérogène, même parmi différentes molécules d’ARNm dérivée d’un gène unique dans une cellule individuelle ; ainsi, des polypeptides différents peuvent être produits à partir d’une molécule d’ARNm unique et le taux de translation peut varier, à la fois sur le plan spatial et sur le plan temporel. Cependant, une question demeure: l’hétérogénéité traductionnelle s’acquitte-t-elle d’une fonction cellulaire ou représente-t-elle prioritairement le bruit de fond d’une expression génique? Dans cette revue de littérature, nous discutons de la base moléculaire et des fonctions potentielles de l’hétérogénéité traductionnelle en tant que telle. Stijn Sonneveld, et al, dans Trends in Cell Biology, publication en ligne en avant-première, 25 mai 2020

Source iconographique, légendaire et rédactionnelle : Science Direct / Traduction et adaptation : NZ

jeudi 6 juin 2019

#Cell #paysagetraductionnel #cœur #homme Le Paysage Traductionnel du Cœur Humain

Novel microproteins = Nouvelles microprotéines
lncRNAs = ARNs non codants de grande taille
circRNAs = ARNs circulaires
Protein truncating variants = variants codant pour des protéines tronquées
Heart failure (DCM) vs Control = Insuffisance cardiaque (Cardiomyopathie Dilatée) versus Controle
Transcription = Transcription
Translation = Traduction

L’expression génique dans les tissus humains ont été d’abord été étudiés au niveau transcriptionnel, négligeant la régulation traductionnelle. 
Ici, nous analysons les translatomes de 80 cœurs humains pour identifier les nouveaux éléments traductionnels et quantifier l’effet de la régulation traductionnelle. Nous montrons l’important contrôle traductionnel de l’expression des gènes cardiaques, qui sont orchestrés d’une manière processus-spécifique. La traduction en aval des variants producteurs de protéines tronquées génératrices de pathologies apparaît survenir fréquemment, suggérant une terminaison inefficace de la traduction. Nous identifions des centaines de microprotéines non détectées auparavant, exprimées à partir des lncRNAs et des circRNAs, dont nous validons les produits protéiques in vivo. La traduction des microprotéines n’est pas circonscrite au cœur ; elles produit également de nombreuses microprotéines constituant les translatomes de reins et de foies humains. Nous associons ces microprotéines avec de divers processus cellulaires et compartiments et trouvons que beaucoup se localisent dans la mitochondrie. De plus, des douzaines de microprotéines sont traduites à partir de lncRNAs pourvus de fonctions non-codantes bien caractérisées, indiquant l’existence d’une biologie précédemment méconnue. Sebastiaan van Heesch, et al, dans Cell, publication en ligne en avant-première, 30 mai 2019

lncRNA = ARN non codant de grande taille
circRNA = ARN circulaire

Source iconographique, légendaire et rédactionnelle : Science Direct / Traduction et adaptation : NZ