#thelancetinfectiousdiseases #Ebola #ZMAb #favipiravir Caractéristiques cliniques et cinétique virale d’un patient atteint par le virus Ebola et guéri rapidement : étude de cas

Cas confirmés et probables de maladie à virus Ebola en date du 20 octobre 2014 en Afrique de l'Ouest. On remarquera que la Sierra Leone est le pays le plus touché de la région, à la fois en termes de cas récents (21 jours et moins) et de cas totaux.
Source iconographique:   http://www.who.int/csr/disease/ebola/ebola-geographic-map-20-oct-2014.png?ua=1

Une description détaillée de cinétique virale, de la durée d’excrétion du virus, du développement du virus dans différentes parties du corps, est recommandée afin de comprendre la pathogénèse du virus Ebola. Les patients atteints d’infections par le virus Ebola admis dans des hôpitaux universitaires fournissent une occasion unique d’investigations poussées sur le plan virologique. Nous décrivons ici le suivi clinique, biologique et virologique d’un cas de maladie à virus Ebola.

Un médecin de 43 ans, qui a contracté une infection à virus Ebola au Sierra Leone en date du 16 novembre 2014 (jour1) ; a été transporté par avion aux Hôpitaux Universitaires de Genève, Suisse, le 5^ème jour suivant le déclenchement de la maladie. Le patient a reçu un traitement antiviral expérimental avec des anticorps monoclonaux (ZMAb) et favipiravir. Nous avons suivi la cinétique de la charge virale quotidiennement, estimé la clairance virale, calculé la demi-vie du virus dans le plasma, et analysé la séquence du génome viral par séquençage à haut débit, en complément des signes cliniques et biologiques.

Le patient s’est rétabli rapidement, malgré une charge virale initiale élevée (environ 1x10⁷ copies d’ARN viral après le début d’un épisode de fièvre). Nous avons noté une disparition de la charge virale en deux phases. La demi-vie du virus a diminué ; passant de 26 h à 9.5 h après le traitement antiviral expérimental. En comparaison de la séquence de consensus du 18 juin 2014, l’isolat responsable de l’infection de ce patient a présenté seulement cinq substitutions nucléotidiques synonymes sur le génome entier (4901A→C, 7837C→T, 8712A→G, 9947T→C, 16201T→C) malgré cinq mois de transmission interhumaine.

Cette étude met l’accent sur l’importance des investigations en matière virologique dans la totale compréhension de l’évolution de la maladie à virus Ebola et de l’adaptation du virus. Quant à savoir si la disparition progressive du virus est due aux seuls effets de la réponse immunitaire, à un bénéfice additionnel du traitement antiviral ou à une combinaison des deux, cette question reste à élucider. Une analyse virologique poussée, ansi que des essais cliniques randomisés contrôlés sont nécessaires avant qu’une conclusion sur l’effet potentiel du traitement antiviral puisse être tirée. Manuel Schibler, MD, et al, dans The Lancet Infectious Diseases, publication en ligne en avant-première, 19 Juin 2015

Financement : Hôpitaux Universitaires de Genève, Office fédéral de la santé publique (OFSP), Agence suisse pour le développement et la coopération, Fonds National Suisse de la Recherche Scientifique (FNRS)

Source : The Lancet Online / Traduction et adaptation : NZ

#OMS #Ebola #fluides #électrolytes Fièvre à virus Ebola : soins cliniques et recherche axée sur le patient

Fluides véhicule pour administration parentérale (...)
Source iconographique: http://www.fresenius-kabi.be/fr/5743.htm

Les auteurs d’un commentaire mettent en lumière le besoin d’une gestion meilleure des fluides et électrolytes chez les patients atteints de fièvre Ebola. Ils déclarent : "Les protocoles de gestion des fluides et électrolytes peuvent et devraient être développés. L’OMS devrait faire usage de son pouvoir pour réunir les experts cliniciens concernés pour examiner les données et rédiger des protocoles. Comme montré dans le film video, il y a plusieurs voies d’accès parentéral pour l’administration de fluides et d’électrolytes. Nous ne soutenons aucune approche en particulier, notre but est plutôt de résumer les options disponibles qui pourraient être d’usage en clinique ou évalués dans des essais."  Ian roberts, Anders  Perner, Une de Page d’Accueil The Lancet Online et The Lancet, Volume 384, Issue 9959, Pages 2001 – 2002, 6 décembre 2014

Source : The Lancet Online / Traduction et adaptation : NZ

#génie-génétique #in-vitro #glucose-sensors #Ebola Réseau de gènes de synthèse sur support papier

Une plateforme de biologie synthétique sur papier permet le déploiement de circuits par génie génétique bien au delà du tube à essai et du laboratoire et permet également la programmation d'outils diagnostiques agissant comme détecteur de glucose ou  du virus Ebola.
Source iconographique et légendaire: http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0092867414012914

Les réseaux de gènes sur support papier offrent un large éventail d’utilisations dans la reprogrammation et le rétablissement des connexions entre organismes. À ce jour, il n’a été trouvé aucun moyen d’exploiter le large potentiel de ces réseaux, au-delà des contraintes que l’on rencontre in vitro en laboratoire, ou in vivo dans la nature. Nous présentons ici un modèle in vitro qui se présente sous la forme d’une plateforme papier qui fournit à la fois une option alternative et polyvalente aux experts en biologie synthétique pour opérer, et le milieu nécessaire au déploiement en toute sécurité de circuits relevant du génie génétique, dont la problématique dépasse le simple  cadre du laboratoire. Des systèmes acellulaires,  lyophilisés à froid sur support papier sont commercialement disponibles ; ils permettent une diffusion de technologies basées sur des principes de biologie synthétique pour la clinique, la santé mondiale, l’industrie, la recherche et l’enseignement. Ces systèmes, dans leur polyvalence, sont à la fois bon marché, stériles, et abiotiques. Pour les besoins sur le terrain, nous créons des circuits produisant un tracé colorimétrique permettant un suivi aisé par un personnel, et fabriquons également des interfaces d’optique électronique à bas coût. Nous faisons la démonstration de cette technologie à l’aide de petites molécules et d’ARN agissant sur des interrupteurs génétiques, du prototypage rapide de circuits géniques complexes, et programmons du diagnostic in vitro, notamment dans les domaines des sensors de glucose et des sensors viraux spécifiques aux souches de virus Ebola. Keith Pardee et al dans Cell, publication en ligne en avant – première, 24 octobre 2014

Source : Science Direct / Traduction et adaptation : NZ

#Ebola #EVD #épidémie #modélisation Dynamique et contrôle de la transmission du virus d’Ebola à Montserrado, Liberia : analyse par modélisation mathématique

Cartographie du foyer initial de l'épidémie d'EVD (Ebola). On notera que la zone définie par un halo rouge - zone de circulation du virus - recouvre une zone située en Guinée, ainsi qu'une autre zone, plus petite, située au nord du Liberia.
Source iconographique et légendaire: http://www.inserm.fr/espace-journalistes/l-inserm-et-l-institut-pasteur-identifient-une-nouvelle-variante-du-virus-ebola-en-guinee

Un renforcement considérable en matière d’intervention de santé publique est nécessaire, afin d’exercer un contrôle sur l’ampleur sans précédent de l’épidémie du virus ebola (EVD) en Afrique de l’Ouest. Les engagements internationaux visent à amplifier la capacité d’intervention dans trois domaines : nouveaux centres de traitement de l’EVD, constatation des cas par le truchement du dépistage systématique, et fourniture de kits de protection des habitations. Notre but était d’évaluer à quel point ces interventions pourraient être appliquées, à la fois sur un plan individuel et sur le plan des communautés, afin de prévenir la survenue de nouveaux cas d’EVD et de décès causés par l’EVD dans le futur.

Nous avons développé un modèle de transmission du virus Ebola permettant d’établir l’existence éventuelle d’une corrélation entre son étendue et le nombre de cas d’EVD et de décès par EVD rapportés dans la comté de Montserrado (Liberia). Nous avons appliqué de modèle pour l’évaluation de l’efficacité de l’augmentation du nombre de centres de traitement de l’EVD, de l’augmentation des actions de dépistage des cas nouveaux, et de la fourniture de kits de protection pour le contrôle de la propagation de la maladie à Montserrado. Les kits de protection fournis offraient une efficacité variant entre 10% et 50%. Nous avons effectué une comparaison prospective de ce que seraient les initiations d’intervention prévisionnelles commençant le 15 octobre 2014, le 31 octobre 2014, et le 15 novembre 2014. Le cadre de l’intervention a été défini et arrêté en termes de dépistage systématique et de capacité déclarée des centres de traitement de l’EVD en date du 23 septembre 2014, concernant également les compte-rendus de tous les schémas comportementaux et de contact entre les personnes relatifs à la transmission du virus en temps réel. Le critère principal d’évaluation était la mesure du nombre de cas attendus en date du 15 décembre 2014.

Nous avons estimé le taux basal de reproduction du virus EVD dans le comté de Montserrado à 2.49 (Intervalle de Confiance [IC] 95% 2.38-2.60). Notre postulat est que la mise à disposition de 4 800 lits supplémentaires dans les centres de traitement de l’EVD et la multiplication par cinq de la capacité de dépistage en novembre 2014 peut empêcher la survenue de 77 312 (IC 95% 68 400 – 85 870) cas d’EVD en rapport avec la situation arrêtée au 15 décembre 2014. En complétant ces mesures par la fourniture d’un kit de protection élèvera l’évaluation de la prévision de non -survenue de la maladie à 97 940 (90 096- 105 606) cas d’EVD. En cas de déploiement de ces mesures le 15 octobre 2014, ces mêmes interventions pourraient permettre la non – survenue de 137 432 (129 736 – 145 874) cas d’EVD. Si ces interventions sont reportées au 15 novembre 2014, nos prévisions sont que ces interventions permettront, au mieux, la non – survenue de 53 957 (46 963 – 60 490) cas d’EVD.

Le nombre total de lits dont les centres de traitement de l’EVD ont besoin pour contrôler efficacement l’EVD dans le comté de Montserrado dépasse les 1 700 unités promises par les États – Unis d’Amérique (USA) pour l’Afrique de l’Ouest tout entière. L’amplification du dépistage de nouveaux cas est nécessaire, afin de maximiser l’efficacité de l’augmentation de capacité des centres de traitement de l’EVD. La distribution de kits de protection peut encore augmenter le taux non – survenue de nouveaux cas d’EVD, mais cela n’est en aucun cas une mesure à prendre indépendamment d’autres mesures, pour le contrôle de la propagation de l’épidémie et pour en empêcher son catastrophique impact sur le nombre de cas d’EVD et de décès dus à l’EVD. Joseph A Lewnard et al, dans The Lancet Infectious Diseases, publication en ligne en avant – première, 24 octobre 2014

Financement: US National Institute of Health

Source: The Lancet Online / Traduction et adaptation: NZ