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| Marquage MS2 des loci endogènes L'imagerie du site de transcription montre une hétérogénéité d'activité transcriptionnelle Il est décrit ici un modèle d'intégré de régulation génique |
La régulation transcriptionnelle chez les
métazoaires survient par le truchement de contacts prolongés entre
amplificateurs et promoteurs de gènes ; ainsi, la plupart des gènes sont
transcrits en « rafales épisodiques » de synthèse d’ARN.
Afin de
comprendre la relation s’établissant entre ces deux phénomènes et la relation
dynamique des gènes en réponse à des signaux s’opérant en amont, nous décrivons
l’utilisation de l’imagerie de l’ARN sur cellules vivantes couplée avec la méthode de
capture de conformation chromosomique au niveau du génome entier (Hi-C) et
disséquons la régulation endogène du gène TFF1
répondant aux œstrogènes.
Bien que TFF1
soit hautement inductible, nous observons de courtes périodes actives et des
périodes inactives de durée variable allant de quelques minutes à plusieurs
jours. L’hétérogénéité des périodes inactives donne lieu à ce que l’on appelle
communément le « bruit » dans l’expression génique humaine et
explique la distribution des protéines dans les tissus humains.
Nous construisons ce faisant un modèle mathématique de régulation relayant la transcription, la
structure chromosomique, et la capacité de la cellule à capter les changements
de niveaux en oestrogènes et à prédire l’importante dynamique de cette
hypervariabilité ; tout cela ne reflète toutefois pas un état biologique stable. Joseph
Rodriguez, et al, dans Cell, publication en ligne en avant-première, 13
décembre 2018
