mardi 26 février 2019

#Cell #génome #organisation #3D Hétérogénéité Majeure et Variation Intrinsèque dans l’Organisation Spatiale du Génome

DNA fibers coils into fibers : Les fibres d'ADN se torsadent en fibres
Fibers folds into intrisically variable domains = Les fibres se replient en des domaines intrinsèquement variables
Domains stack into variable long-range interactions = Les domaines s'agglutinent et établissent des interactions à long terme
Without coordination between alleles = Sans coordination entre les allèles
Quelques principes généraux de l’organisation tridimensionnelle (3D) du génome ont récemment été établis, incluant ceux du positionnement non-aléatoire des chromosomes et des gènes dans le noyau de la cellule, des compartiments chromatiniens distincts, et des domaines d’associations topologiques (TADs). Cependant, l’étendue et la nature de la variabilité intercellulaire et intracellulaire de l’architecture génomique ne sont que peu caractérisées. Ici, nous examinons l’hétérogénéité de l’organisation du génome. Une cartographie de centaines d’interactions intra-chromosomales chez des fibroblastes pris individuellement, présente de faibles fréquences d’association, qui sont déterminées par la distance génétique, l’architecture chromatinienne de haut niveau, ainsi que par l’environnement chromatinien. La structure des TADs varie entre les cellules prises individuellement, et les associations inter-TAD sont fréquentes. De plus, une analyse au niveau de la cellule unique révèle un comportement indépendant des allèles pris individuellement au niveau des noyaux simples. Nos observations révèlent une très grande variabilité et hétérogénéité de l’organisation du génome au niveau des allèles pris individuellement et démontrent la coexistence d’un large spectre de configurations génomiques au sein d’une population donnée de cellules. Elizabeth H. Finn et al, dans Cell, publication en ligne en avant-première, 21 février 2019

Source iconographique, légendaire et rédactionnelle : Science Direct / Traduction et adaptation : NZ

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