mardi 20 août 2019

#Cell #microbiome #génomique Les Analyses à Grande Échelle du Microbiome Humain Révèlent des Milliers de Nouveaux Petits Gènes

Small Proteins = Petites Protéines
Cluster Based on Amino Acid Conservation = Regroupement Basé sur la Conservation des Acides Aminés
Taxonomic Assignement = Attribution Taxonomique
Location = Localisation
Cow Gut = Intestin de la Vache
Putative Function = Fonction Supposée
Antiphage Activities = Activité Antiphagique
Cell-Cell Communication = Communication Intercellulaire
Antimicrobial Activities = Activités Antimicrobiennes
Les Petites protéines sont traditionnellement négligées du fait de la difficulté computationnelle et expérimentale à les détecter. Afin d’identifier les petites protéines de façon systématiques, nous avons réalisé une étude génomique comparative sur 1 773 métagénomes associés à l’homme de quatre sites différents du corps.  Nous décrivons plus de 4000 familles de protéines conservées, nouvelles pour la plupart ; environ 30% de ces familles de protéines sont destinées à être sécrétées ou à être transmembranaires. Plus de 90% des petites familles de protéines ne possèdent pas de domaine connu et presque la moitié d’entre elles ne sont pas représentées dans les génomes de référence. Nous identifions des protéines supposées « domestiques »*, spécifiques aux mammifères, liées à la défense ainsi que des familles de protéines, susceptibles d’être soumises à un transfert horizontal. Nous fournissons des évidences de transcription et de traduction sur un échantillon de ces familles de protéines. Notre étude suggère que les petites protéines sont très abondantes et que celles du microbiome humain, en particulier, peuvent servir à la réalisation de fonctions inconnues jusqu’à présent. Hila Sberro, et al, dans Cell, publication en ligne en avant-première, 8 août 2019

Source iconographique, légendaire et rédactionnelle : Science Direct / Traduction et adaptation : NZ

*protéine domestique : protéine qui participe aux processus métaboliques fondamentaux dans presque toutes les cellules d’un organisme multicellulaire. (source: Wikitionnaire)

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