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| Topologie Génomique du Cancer Human colon = Colon humain Normal nuclei = noyaux de cellules normales Tumor nuclei = noyaux de cellules tumorales Normal cells = Cellules normales Excessive replication = Réplication excessive Suppression TumoraleNormal nucleus = Noyau normal Tumor/aging = Tumeur / vieillissement compartment = compartiment DNA hypomethylation = Hypométhylation de l'ADN Excessive replication = Réplication excessive Impact of compartments |
Les changements en termes de méthylation de l’ADN
et ses impacts sur la chromatine sont bien documentés, mais le destin des
structures chromosomiques d’ordre supérieur reste peu connu. Ici, nous
intégrons les données topologiques des tumeurs du colon et celles du colon
normal avec les données épigénétiques, transcriptionnelles et d’imagerie pour
caractériser les altérations affectant les boucles de chromatique, des domaines
topologiquement associés, et des compartiments à grande échelle. Nous trouvons
que le cloisonnement des compartiments ouverts et fermés du génome est fortement
altéré dans les tumeurs. Cette réorganisation est accompagnée par une hypométhylation
compartiment-spécifique et des changements de la chromatine. De plus, nous
identifions un compartiment à l’interface des compartiments canoniques A et B subissant
une réorganisation, en situation tumorale. Il est remarquable de noter que de
tels changements frappants surviennent également chez des cellules
non-malignes ayant accumulé un nombre excessif de divisions. Nos analyses suggèrent que ces
changements topologiques répriment le caractère « souche » et le caractère invasif des cellules tumorales tout en induisant les gènes d’immunité anti-tumorale; restreignant ce faisant
la progression de la malignité. Ces résultats remettent en question la vision
conventionnelle selon laquelle les altérations épigénomiques associées aux
tumeurs sont principalement d’origine oncogénique. Sarah Johnstone, et al, dans
Cell, publication en ligne en avant-première, 24 août 2020
Source iconographique, légendaire et rédactionnelle :
Science Direct / Traduction et
adaptation : NZ
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