#Cell #Th17 #régulationmétabolique #auto-immunité La modélisation métabolique de cellules Th17 individuelles révèle des régulateurs de l'auto-immunité

Single-cell transcriptome = Transcription de l'ARN au niveau d'une cellule unique
Metabolic map = Carte métabolique
Compass = "algorithme de caractérisation des états métaboliques basé sur le séquençage de l'ARN unicellulaire et l'analyse de l'équilibre des flux"
Reaction differential activity = Activité réactionnelle différentielle
Il est à noter que le profil "Compass" est différent chez les cellules Th17 pathogènes (en fuscia) et les cellules Th17 non pathogènes (en vert).

 

Le métabolisme est un régulateur majeur de la fonction des cellules immunitaires, mais il reste difficile d'étudier le statut métabolique des cellules individuelles. Ici, nous présentons Compass, un algorithme pour caractériser les états métaboliques cellulaires basé sur le séquençage de l'ARN unicellulaire et l'analyse de l'équilibre des flux. Nous avons appliqué Compass pour associer les états métaboliques à la variabilité fonctionnelle du T helper 17 (Th17) (potentiel pathogène) et avons récupéré un commutateur métabolique entre la glycolyse et l'oxydation des acides gras, semblable aux différences connues entre Th17/cellules T régulatrices (Treg), que nous avons validées par métabolisme dosages. Compass a également prédit que la pathogénicité du Th17 était associée au métabolisme de l'arginine et des polyamines en aval. En effet, l'expression enzymatique liée aux polyamines a été renforcée dans les Th17 pathogènes et supprimée dans les cellules Treg. Une perturbation chimique et génétique du métabolisme des polyamines a inhibé les cytokines Th17, favorisé l'expression de Foxp3 et remodelé le transcriptome et l'épigénome des cellules Th17 vers un état de type Treg. Des perturbations in vivo de la voie des polyamines ont modifié le phénotype des cellules T encéphalitogènes et atténué l'inflammation tissulaire dans l'auto-immunité du SNC. Allon Wagner, et al, dans Cell, publication en ligne en avant-première, 2 juillet 2021

Source iconographique, légendaire et rédactionnelle : Science Direct / Préparation post : NZ