Nous
avons examiné l’histoire évolutionnaire menant à la résistance des pathogènes
hospitaliers aux médicaments, les entérocoques, à partir de leurs origines il y
a des centaines d’années. Notre but était de comprendre comment, parmi la
grande diversité de la flore intestinale, les entérocoques sont aussi bien
adaptés à l’environnement hospitalier moderne. L’estimation de l’horloge
moléculaire, mutualisée à leur distribution environnementale, leur diversité
phénotypique, et la concordance avec les registres fossiles de l’hôte, placent
les origines des entérocoques à une période correspondant à l’arrivée des
premiers animaux sur terre, il y a quelques 425-500 millions d’années. Leur
spéciation semble être parallèle à la diversification des hôtes, notamment du
fait de l’émergence rapide de nouvelles espèces d’entérocoques au cours de la
période suivant la fin de l’extinction du permien. Les principales forces
motrices de la spéciation incluent les changements en disponibilité en hydrates
de carbone de l’intestin de l’hôte. Il semble que la vie sur la terre ferme ait
sélectionné les entérocoques pathogènes pour les caractéristiques précises qui leur
permettent aujourd’hui de survivre à la dessiccation, au jeûne, à la désinfection
dans les hôpitaux modernes ; ils étaient donc prédestinés à émerger et à s’installer
comme pathogènes hospitaliers principaux. François Lebreton, et al, dans Cell,
publication en ligne en avant-première, 11 mai 2017
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